Одним из принципов инновационного университета, концепция которого разработана в ТПУ, является двухуровневая система стратегического и тактического управления университетом.
В Томском политехническом университете высшим органом стратегического управления становится Ассамблея, включающая в себя Совет попечителей, Правление Ассоциации выпускников и Учёный совет университета.
6 декабря 2007 года состоится первое собрание Ассамблеи.